平行反应仪在有机化学中的应用非常广泛。它能够进行多种合成反应、回流萃取反应、惰性气体条件反应、在位蒸馏浓缩反应等。它还可以用于药物合成、有机合成反应、方法学研究、金属催化研究、有机小分子催化、不对称催化、合成研究、配合物合成、糖化学研究、金属有机合成、晶体工程研究、化学生物学、分析化学、高分子合成、无机合成、手性化合物拆分、控温搅拌工艺、混合萃取提取、合成工艺优化、结晶工艺、化合物库构建、构效关系研究、反应机理研究、全合成研究、组合化学合成、活性化合物库合成及分子库构建等领域。